Охрана Природного парка обеспечивается дирекцией Природного парка во взаимодействии с республиканским органом исполнительной власти в области охраны окружающей среды - Министерством природных ресурсов и экологии Республики Тыва.
Государственный надзор в области охраны и функционирования Природного парка в соответствии с законодательством Российской Федерации и Республики Тыва осуществляется органом исполнительной власти Республики Тыва в области охраны окружающей среды - Министерством природных ресурсов и экологии Республики Тыва.
Контроль за соблюдением законодательства в области охраны и использования объектов животного и растительного мира и среды их обитания на территории Природного парка в соответствии с законодательством Российской Федерации и Республики Тыва осуществляется органом исполнительной власти Республики Тыва в области охраны окружающей среды.
Государственный лесной контроль и надзор на территории Природного парка осуществляется органом исполнительной власти в области лесных отношений - Государственным комитетом по лесному хозяйству Республики Тыва.